La CPCFQ est chargée d’élaborer et de mettre en œuvre un programme d’activités de coopération définies par les gouvernements français et québécois. Ceux-ci veulent encourager de nouveaux projets pour 2007 – 2008 dont les principale cause concerne : la traçabilité alimentaire , l'optique et la photonique, les nouvelles énergies , le changements climatiques ,innovation sociale (insertion des jeunes et des immigrants),

Le Centre de coopération interuniversitaire franco-québécoise (CCIFQ) crée en 1984 par la Commission permanente de coopération franco-québécoise. Sa mission principale est de promouvoir et de valoriser la coopération interuniversitaire entre la France et le Québec.

La CCIFQ à pour principal but de promouvoir des enseignements et des programmes de recherche en commun mené par des universitaires français et québécois ;favoriser le développement des connaissances sur le Québec en France et sur la France au Québec ;